云浮市疾病预防控制中心于2002年6月在原云浮市卫生防疫站基础上组建，为云浮市卫生健康局下属事业单位，公益一类，副处级，经费按财政补助一类，人员经费、发展建设和业务经费由政府全额安排。中心领导班子一正两副，设12个副科级内设机构（办公室、总务科、应急办公室、宣教科、公共卫生科、传染病预防控制科、职业卫生与放射卫生科、慢性非传染性疾病预防控制科、艾滋病预防控制科、免疫规划科、门诊部、检验中心）。